早在2009年，華北制藥就制定了《青霉素清潔生產企業標準》，過濾水循環使用、真空泵水循環使用、苯乙酸循環使用等一系列清潔生產措施，并廣泛使用。發酵車間零排放，溶劑冷回收等清潔生產工藝技術也在不斷創新。

    溶媒消耗的降低也同時降低了環保壓力，為優化處理藥渣做貢獻。在抗生素藥渣無害化焚燒處置實驗中發現，采用800℃的焚燒環境下，利用一個燃室焚燒的處理辦法，對不同的抗生素菌渣進行無害化實驗研究，并對焚燒殘渣中的效價、重金屬含量和焚燒廢氣進行檢測，均滿足相關排放標準。該焚燒實驗通過國家環保部組織的專家論證。